NGS vs. qPCR | 合法醫療器材資訊網
WhileqRT-PCRisusefulforquantifyingtheexpressionofafewgenes,itcanonlydetectknownsequences.Incontrast,RNAsequencing(RNA-Seq)usingNGS ...
Advantages of RNA-Seq vs. qPCRWhile qRT-PCR is useful for quantifying the expression of a few genes, it can only detect known sequences. In contrast, RNA sequencing (RNA-Seq) using NGS can detect both known and novel transcripts. Because RNA-Seq does not require predesigned probes, the data sets are unbiased, allowing for hypothesis-free experimental design.
For read-counting methods, such as gene expression profiling, the digital nature of NGS allows a virtually unlimited dynamic range. RNA-Seq quantifies individual sequence reads aligned to a reference sequence, producing absolute rather than relative expression values. This broad dynamic range enables detection of subtle changes in expression, down to 10%. Beyond quantifying gene expression, RNA-Seq can identify novel transcripts, alternatively spliced isoforms, splice sites, and small and noncoding RNA.1,2
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