16S 核糖體RNA | 合法醫療器材資訊網
功能[編輯]·16SrRNA具有與原核生物核糖體大亞基中的23SrRNA相似的結構決定功能,可作為核糖體蛋白質結合的架構。·16SrRNA的3'端含有能與mRNA上游AUG ...
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嗜熱棲熱菌(Thermus thermophilus)的30S亞基的三維分子結構圖。分子中的淡藍色部分為蛋白質,淡橙色部分為RNA單鏈。[1]16S核糖體RNA(16S ribosomal RNA),簡稱16S rRNA,是原核生物的核糖體中30S亞基的組成部分。16S rRNA的長度約為1,542 nt。卡爾·烏斯和喬治·福克斯是率先在系統發育中使用的16S rRNA基因的兩個先驅者[2]。
一個細菌的細胞中可包含多個具有不同序列的16S rRNA[3]。
已知16S rRNA具有如下幾項功能:
通用引物[編輯]由於不同種的真細菌與古細菌間的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的[5],16S rDNA常被用於對各種生物進行的系統發生學方面的研究[6]這種運用16S rRNA對生物進行系統發生學研究的方法由卡爾·沃斯(Carl Woese)開創[7]。另外,粒線體和葉綠體中的rRNA也都被擴增了。在獲得能提供系統發育學信息的16S rRNA分子時需要利用通用PCR引物對16S rRNA分子進行擴增。16S rRNA序列的對比分析需要在這類「通用引物」的脫氧核糖核酸分子的輔助下完成,這類分子具有如下序列:
8UA正向:5-AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG-3 519B反向:5-GTA TTA CCG CGG CKG CTG-3 反向:ACG GCT ACC TTG TTA CGA CTT這類引物因並未在近期發現的幾種屬於納古菌門(Nanoarchaeota)的熱液古菌[8]中分離識別出來,也被稱為准通用引物。
...微生物體16S擴增子定序(16S Amplicon Sequencing) | 合法醫療器材資訊網
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