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對於一般微生物而言,其解析度已能達到「種」層次的鑑別,甚至是近緣物種之區分,因而被認為具有取代細菌16SrRNA基因定序比對之潛力1,2,3。MALDI-TOFMS技術比對菌株 ...
人工智慧的「黑箱作業」,類神經網路如何將生物分類的?
作者/吳育瑋 臺北醫學大學醫學資訊研究所助理教授
這篇文章是我在讀到 Nature Methods 在 2018 年 3 月 5 日刊登的文章「Using deep learning to model the hierarchicalstructure and function of a cell」1後,在臉書 MiTalk 社團寫下的三篇短文的整理集結。在這三篇短文中,我簡要地介紹了目前人工智慧的技術基礎「類神經網路」的概念,再將其延伸到這篇文章提及的系統生物學研究,並解釋目前類神經網路之所以被稱為「黑盒子」的原因,以及這項系統生物學研究處理黑盒子的手法。
資訊輸入和輸出,如何用「類神經網路」做出無人車?我們先來聊聊目前機器學習中最火紅的演算法「類神經網路」究竟是什麼東西?
動物的神經元大致上都有著可以接受來自其他神經元的訊號的樹突 (dendrite),以及可以傳送訊號給其他神經元的軸突 (axon)。類神經網路的單位神經元架構與生物的神經元類似:都有著數個可以接受其他神經元的「輸入 (Input)」,以及數個傳送訊號給其他神經元的 「輸出 (Output)」。將一大堆這樣子的神經元連結起來,就是類神經網路了。
當然,這種連結也不是亂連的。類神經網路通常會分成好幾「層」,而每一層與每一層之間的神經元都會緊密連結著 (fullyconnected),以下我用個實際的例子來說明這所謂的「層」是怎麼回事。
在 1989 年的時候,卡內基美隆大學發明了第一台透過類神經網路控制的無人車 ALVINN 2。這台無人車的主要架構有三個:一台在車子前面隨時拍照的照相機或攝影機,一台執行類神經網路運算的電腦,以及由電腦控制的方向盤,請參考下圖:
第一層(最底層):照相機照出來的 30 x 32 個 pix...MALDI | 合法醫療器材資訊網
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