Gene Id Conversion Tool | 合法醫療器材資訊網
HereissomeexamplesyntaxforIDconversionfromthepythonmodule:...Forexample,forconvertingfromEnsemblGeneidstoGenesymbols,youcouldusea ...
MyGene.info[1] is a web service that provides up to date annotations in several fields and is great for gene ID conversion. All species from NCBI and Ensembl are supported and annotations are updated weekly to ensure the latest annotations are available. Both python[2] and R/Bioconductor[3] clients are easy to use.
MyGene.info may not be able to solve your problem with Agilent IDs but several other IDs from Genebank, Uniprot, Ensembl, Refseq are all available. Also, from either client, you can query several thousand genes at once.
Here is some example syntax for ID conversion from the python module:
>>> import mygene >>> mg = mygene.MyGeneInfo() >>> mg.metadata[available_fields] ## returns available query terms, pay special attention to "ensemblgene", "entrezgene", "symbol" and "uniprot" [uaccession, ualias, ubiocarta, uchr, uend, uensemblg...converting gene symbol to gene ID in bioDBnet | 合法醫療器材資訊網
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