如何用ImageJ對條帶進行定量分析? | 合法醫療器材資訊網
2018年9月21日—其實,它被廣泛用於膠圖條帶的定量分析,如下圖這篇文章就是用ImageJ分析western-blot條帶灰度值(Banddensity)進行相對定量。(Nature,2010).
ImgaeJ是一款比較常用的科研圖片分析軟件,在之前已介紹過用它來進行細胞計數、不同顏色通道的熒光照片的融合和不規則區域面積的測定等(參見 拓展閱讀部分)。
其實,它被廣泛用於膠圖條帶的定量分析,如下圖這篇文章就是用Image J分析western-blot條帶灰度值(Band density)進行相對定量。
(Nature,2010)
下面就介紹下如何用ImageJ 進行條帶的灰度分析。
首先,通過FileOpen打開要分析的膠圖,如下圖。
接下來通過 ImageType8-bit(如下圖)將圖片轉爲爲8位的灰度圖,即從黑到白有256(0~255)種灰色的黑白圖片。
接下來,將膠圖的灰色背景去掉,方法見下圖。
然後用矩形選框工具框選一個條帶或泳道(先選最寬的),然後通過Analyze /gels / select first lane(快捷鍵ctrl+1)爲泳道編號,移動編好的選區複製出新選區,接着通過 Analyze / gels / select secondlane(快捷鍵ctrl+2)爲其他泳道編號,方法見下圖。
完成之後,通過analyze/ gels / plot lanes(快捷鍵 ctrl+3)(如下圖)繪製條帶的峯圖。
接下來只需用魔棒工具(Wand tool)點擊每個峯的中間區域即可逐一完成對峯面積的計算,計算的結果在Result 窗口顯示,可通過File 導出爲xls文件。最後用目標蛋白的面積值除以內參蛋白的面積值,即可得到相對錶達量,進而可繪製柱狀圖。
如過把...
西方點墨法代工Western Blot | 合法醫療器材資訊網
Western Blotting | 合法醫療器材資訊網
Western-blotting | 合法醫療器材資訊網
用ImageJ对条带进行定量分析 | 合法醫療器材資訊網
如何用ImageJ對條帶進行定量分析? | 合法醫療器材資訊網
高分文献中的Western Blot定量柱状图是如何实现的? | 合法醫療器材資訊網
Image J和Graphpad如何对Western Blot条带灰度分析【干货 ... | 合法醫療器材資訊網
如何用ImageJ軟體分析電泳圖@ 經驗 | 合法醫療器材資訊網
輕鬆掌握對Western Blot條帶灰度分析技巧! | 合法醫療器材資訊網
醫學研究部共同研究室 | 合法醫療器材資訊網
【羅氏凡塔那抗ALK(D5F3)兔子單株抗體】許可證字號:衛部醫器輸字第025531號
器材品名:羅氏凡塔那抗ALK(D5F3)兔子單株抗體許可證字號:衛部醫器輸字第025531號註銷狀態:註銷日期:註銷理由:有效日期:2023/...
【"拜爾斯比" 一般目的之反應試劑 (未滅菌) 】許可證字號:衛署醫器輸壹字第010098號
器材品名:"拜爾斯比"一般目的之反應試劑(未滅菌) 許可證字號:衛署醫器輸壹字第010098號註銷狀態:已註銷註銷日期:2018/06/26...
【載酶免疫組織化學染色呈色系統】許可證字號:衛署醫器輸壹字第003210號
器材品名:載酶免疫組織化學染色呈色系統許可證字號:衛署醫器輸壹字第003210號註銷狀態:已註銷註銷日期:2013/01/18註銷理由:...
【凡塔那超視野組織免疫染色鑑定組】許可證字號:衛署醫器輸壹字第005809號
器材品名:凡塔那超視野組織免疫染色鑑定組許可證字號:衛署醫器輸壹字第005809號註銷狀態:已註銷註銷日期:2014/05/05註銷理由...
【〝珈瑪〞單株抗體抗E血型鑑定診斷試劑】許可證字號:衛署醫器輸字第015360號
器材品名:〝珈瑪〞單株抗體抗E血型鑑定診斷試劑許可證字號:衛署醫器輸字第015360號註銷狀態:註銷日期:註銷理由:有效日期:202...
【萊富免疫病理組織化學染色試劑】許可證字號:衛署醫器輸壹字第006135號
器材品名:萊富免疫病理組織化學染色試劑許可證字號:衛署醫器輸壹字第006135號註銷狀態:已註銷註銷日期:2014/04/03註銷理由:...
【免疫分析用品管液-液狀】許可證字號:衛署醫器輸字第017582號
器材品名:免疫分析用品管液-液狀許可證字號:衛署醫器輸字第017582號註銷狀態:註銷日期:註銷理由:有效日期:2021/10/26發證日...
【〝珈瑪〞單株抗體抗 e 血型鑑定診斷試劑】許可證字號:衛署醫器輸字第015210號
器材品名:〝珈瑪〞單株抗體抗e血型鑑定診斷試劑許可證字號:衛署醫器輸字第015210號註銷狀態:註銷日期:註銷理由:有效日期:202...
【百基超敏感聚合體酵素免疫染色試劑組】許可證字號:衛署醫器輸壹字第001795號
器材品名:百基超敏感聚合體酵素免疫染色試劑組許可證字號:衛署醫器輸壹字第001795號註銷狀態:已註銷註銷日期:2012/12/03註銷...
【載酶老鼠抗人類肌動蛋白抗體】許可證字號:衛署醫器輸壹字第004054號
器材品名:載酶老鼠抗人類肌動蛋白抗體許可證字號:衛署醫器輸壹字第004054號註銷狀態:已註銷註銷日期:2013/01/18註銷理由:許...
【歐捷抗核仁抗體測試組】許可證字號:衛署醫器輸字第023825號
器材品名:歐捷抗核仁抗體測試組許可證字號:衛署醫器輸字第023825號註銷狀態:註銷日期:註銷理由:有效日期:2022/07/31發證日期...
【希每克免疫病理組織化學試劑】許可證字號:衛署醫器輸壹字第008475號
器材品名:希每克免疫病理組織化學試劑許可證字號:衛署醫器輸壹字第008475號註銷狀態:已註銷註銷日期:2018/05/28註銷理由:許...
【英傑墨點法一般呈色劑】許可證字號:衛署醫器輸壹字第009009號
器材品名:英傑墨點法一般呈色劑許可證字號:衛署醫器輸壹字第009009號註銷狀態:已註銷註銷日期:2018/05/25註銷理由:許可證已...
【維比斯邦美思自動免疫染色試劑】許可證字號:衛署醫器輸壹字第005056號
器材品名:維比斯邦美思自動免疫染色試劑許可證字號:衛署醫器輸壹字第005056號註銷狀態:已註銷註銷日期:2013/01/18註銷理由:...
【載酶3,氨基-9-乙基卡巴唑免疫組織化學染色溶液】許可證字號:衛署醫器輸壹字第003157號
器材品名:載酶3,氨基-9-乙基卡巴唑免疫組織化學染色溶液許可證字號:衛署醫器輸壹字第003157號註銷狀態:已註銷註銷日期:2013/...